La compareixença judicial com a imputats de tots els membres de l'equip de govern reusenc entre 2007 i 2011 -amb l'exalcalde del PSC Lluís Miquel Pérez al capdavant-, que ha estat avançada per 'reusdigital.cat', es podria allargar durant diversos dies segons les mateixes fonts judicials. Anteriorment, els regidors de l'anterior equip de govern reusenc imputats ja havien prestat declaració davant la Unitat Orgànica de la Policia Judicial de la Guàrdia Civil de Tarragona. També ho havien fet davant Fiscalia altres regidors de l'oposició, tot i que no com a implicats en els fets. 

La investigació dirigida pel jutjat número 3 de Reus vol dilucidar possibles irregularitats en la concessió d'un aval de 3 milions d'euros per part de l'Ajuntament, que va aprovar un ple de febrer de l'any 2008 amb els vots en contra de l'oposició -CiU, PP i CORI-. Constituïda l'any 2007, Shirota Functional Foods (SFF), l'objectiu de la qual era la investigació en nutrició, la salut i els aliments funcionals, comptava amb una participació del 48% de l'empresa privada La Morella Nuts, mentre el 52% restant corresponia a administracions i institucions públiques: principalment, Innova, amb un 40%., tot i que també figuraven a l'accionariat Sagessa, l'Hospital de Sant Joan i la URV.

L'empresa, però, va ser liquidada pel consell d'administració d'Innova amb l'arribada al poder del nou equip de govern de CiU i PP, tot adduint els deutes acumulats, que van ser assumits íntegrament pel consistori. La CUP va decidir portar el cas al Tribunal de Comptes i a Fiscalia. A partir d'aquest punt es van obrir diligències prèvies per determinar si l'objecte de Shirota guarda relació amb el d'Innova, atesa l'existència d'avals creuats entre empreses, aparentment, sense objectes socials vinculats. El grup municipal d'Ara Reus es va presentar com a acusació particular. El cas va explotar públicament just després de la detenció per part de la Guàrdia Civil del director general d'Innova, Josep Prat, al qual se li ha retirat el passaport.

En un comunicat, el PSC ha confirmat la citació com a imputat dels regidors que formaven part de l'equip de govern, els quals, ha assegurat, "estan a disposició de la justícia per aportar tota la informació de què disposin relacionada amb aquesta empresa". Els socialistes, que asseguren confiar en la innocència dels edils, mantenen que l'aval es va concedir en base al pla d'empresa "que garantia la seva viabilitat". Més i tot, consideren que hauria aportat "a mitjà termini beneficis a la ciutat".

Més enllà d'això, consideren que la situació actual, però, és "responsabilitat" de l'equip de govern de CiU i PP per haver aprovat la liquidació de la societat "sense esperar" l'execució del pla d'empresa i l'arribada dels beneficis. "Lamentem que la manca de suport de l'actual equip de govern al projecte de Shirota hagi portat a aquesta situació que no s'hauria d'haver produït mai", han manifestat.